屠宰污水自流經格柵池在格柵的作用下去除廢水中較大的污染物，如碎塊、碎皮肉等物體，以防止堵塞、腐蝕水泵。污水經格柵池后自流到調節池，污水在調節池中進行充分的混合，使水質水量得到均衡。污水經調節池后再經泵前加藥把污水提升到氣浮池中，在溶氣水的作用下，進行固液分離，去除絕大部分的油脂、懸浮物及部分有機污染物。如果油脂過多，進入生物處理系統，將影響生物處理的效果。

污水經氣浮池后自流到缺氧池，缺氧池所起到的作用一方面可分解有機污染物大部分復雜高分子物質，提高污水可生化系數。污水在缺氧池中停留，那些難以生化的高分子有機物大部分被分解為低分子易生化的有機物，且部分易生化的有機物在微生物共同作用下最終被轉化為水、無機物和微生物污泥而在污水中去除。厭氧使污水中的難降解的有機物及其發色基團解體、被取代或裂解（降解），從而降低污水的色度，改善污水的可生化性，即使不能直接降低污水的色度，由于分子結構或發色基團已發生改變，也可使其中在好氧條件下容易被降解并脫色。另一方面，反硝化菌大量存在缺氧池內，在缺氧條件下將硝酸鹽、亞硝酸鹽轉化為氮氣。

缺氧池出水流入活性污泥池。在曝氣機通氣供氧下，好氧微生物將有機物質分解為CO2和水等無機物質，或合成為自身需要，進行新陳代謝。污水中有機污染物經好氧池生化處理后大部分得以去除。好氧池混合液用泵回流至活性污泥池進水口，提高污水的處理效果；處理水流入二沉池，泥水自然分離；沉于污泥斗中的污泥用污泥泵抽送回流至缺氧池進行再消化，剩余污泥用泵輸送排至污泥池中待處理。