港珠澳車牌配額申請資格較其他口岸寬松，申請企業在廣東省投資不設下限，只需與包括申請年度在內的三年內累計納稅十萬元人民幣以上；或列入國家高新技術企業名錄也符合資格。個人申請者則須在廣東省慈善捐款不少于五百萬元人民幣，對于一些華僑或者海外投資者也有相應的車指標配額。

港珠澳大橋電子不停車收費系統兼容香港和國標ETC標準及系統，采用基于5.8G（國標）和2.45G（港標）ETC收費技術；硬件上，大橋的主體工程實現了一處主線收費站的雙向20條收費車道，均支持電子不停車收費（ETC）和人工收費（MTC）方式的創舉。

港珠澳車牌申請條件：

1、境外投資者在廣東省參與投資項目，納稅額達到10萬以上即可申請1個入出內地的港粵兩地車牌，納稅額達到50萬以上的可申請辦理2個出入內地的港粵兩地車牌，納稅額達到100萬以上的即可申請3輛。這是提到的納稅額是指三年累積的額度，申請年度包括在內

2、作為廣東省的縣級以上人大代表或者政協委員可提出申請1個出入內地的港粵兩地車牌。

3、對廣東省公益事業有杰出貢獻的境外人士，即海外華人華僑，港澳臺同胞。從改革開放以來為公益事業提供捐助款達到500萬人民幣以上的可申請辦理1個經港珠澳大橋入出內地的車輛車牌。

4、列入國家高新技術企業名單的外資企業，有資格申請1個經港珠澳大橋口岸的港粵兩地車牌。